Tretia komora je jedným zo štyroch komôr v mozgu, ktoré komunikujú navzájom. Rovnako ako v iných komorách mozgu je naplnená mozgomiešnou tekutinou, ktorá pomáha chrániť mozog pred zranením a transportuje živiny a odpad. Tretia komora je úzka dutina, ktorá sa nachádza medzi dvoma polovicami mozgu.
Tretia komora zasiela správy a prijíma správy od bočných komôr, ktoré sú umiestnené pred treťou komorou, a akvaduktu stredného mozgu, ktorý sa nachádza priamo za treťou komorou. Hypotalamus a talamus sa nachádzajú na stranách tretej komory.
Abnormality tretej komory sú spojené s rôznymi stavmi vrátane hydrocefalu, meningitídy a ventrikulitídy. Hydrocefalus je nadmerné hromadenie tekutiny v mozgu. Meningitída je zápal membrán, ktoré pokrývajú mozog a miechu, zatiaľ čo ventrikulitída je zápalový stav komôr. Meningitída a ventrikulitída môžu byť zapríčinené traumou do komory vrátane tretej komory, traumatická meningitída je vzácna.
Zväčšená tretia komora bola spojená s psychiatrickými chorobami, ako je schizofrénia; správnosť tejto teórie však nebola presvedčivo dokázaná.
