Mužský pohlavný systém sa skladá z vonkajšej aj vnútornej časti. Vonkajšie mužské pohlavné orgány zahŕňajú penis, močovú trubicu a miešok. Vnútorné mužské pohlavné orgány zahŕňajú semenný váčok, semenníky, vazelíny, epididymis, prostatu, bulburetrálnu žľazu a ejakulačný kanálik.
Penis je hlavnou súčasťou vonkajších mužských genitálií, ktoré majú sexuálne aj telesné funkcie. Je schopný ejakulovať spermie (obsahujúce spermie) počas sexu a zbaviť telo moču. Močovina transportuje moč z močového mechúra z mužského tela. Semeno tiež cestuje močovou trubicou.
Každý samec má dve vrecká na drieky, v ktorých sú umiestnené určité časti vnútorných mužských pohlavných orgánov (epididymis, semenníky a dolné spermatické šnúry). Semenníky sú najdôležitejšou súčasťou vnútorných mužských genitálií, pretože vytvárajú a ukladajú spermie a zásobujú mužské telo hormónmi, ktoré kontrolujú vývoj mužských charakteristík a reprodukčných orgánov.
Epididymis ukladá, dozrieva a transportuje spermie medzi semenníkmi a vas deferens, ktoré smerujú spermie smerom k močovej trubici. Semenné vezikuly susedia s močovou trubicou a vylučujú mliečnu tekutinu, ktorá sa nakoniec vyprázdňuje ejakulačným kanálikom. Pri vyprázdňovaní spermy tiež pomáhajú bulburetrálne žľazy.